Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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