Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms