Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JAG1P78504 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JAG1P78504 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JAG1P78504 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms