Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ABCE1P61221 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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