Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms