Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT2P45379 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms