Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGP37231 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms