Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFC1P35251 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms