Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms