Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBTFP17480 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBTFP17480 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBTFP17480 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms