Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms