Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms