Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms