Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM5Q9C035 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms