Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms