Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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