Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPRY1Q96DX4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms