Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BLNKQ8WV28 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms