Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L2Q8NAA4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms