Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM71DQ8N9W8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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