Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2Z1

TICRR, Treslin, humanhuman

Predictions only

Length 1,910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TICRRQ7Z2Z1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TICRRQ7Z2Z1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TICRRQ7Z2Z1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms