Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms