Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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