Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms