Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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