Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PDCD1Q15116 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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