Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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SHROOM2Q13796 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHROOM2Q13796 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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