Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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