Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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