Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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