Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MS4A2Q01362 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms