Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms