Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP2P78314 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP2P78314 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP2P78314 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP2P78314 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP2P78314 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2P78314 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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