Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms