Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms