Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms