Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms