Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF1P30408 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF1P30408 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms