Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PRKCHP24723 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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