Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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