Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BGNP21810 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BGNP21810 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BGNP21810 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BGNP21810 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms