Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NTF3P20783 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NTF3P20783 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NTF3P20783 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NTF3P20783 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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