Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms