Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms