Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TIMM17BO60830 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms