Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CXCL13O43927 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CXCL13O43927 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CXCL13O43927 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CXCL13O43927 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CXCL13O43927 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CXCL13O43927 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL13O43927 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CXCL13O43927 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CXCL13O43927 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL13O43927 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL13O43927 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CXCL13O43927 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL13O43927 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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