Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms