Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms