Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TIMMDC1Q9NPL8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TIMMDC1Q9NPL8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TIMMDC1Q9NPL8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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