Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMG20AQ9NP66 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMG20AQ9NP66 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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